中国科学院合肥肿瘤医院原名中国科学院合肥物质科学研究院肿瘤医院，坐落于合肥西郊的中科院重点科研基地科学岛上，是由安徽省卫生和计划生育委员会批准设置、中国科学院合肥物质科学研究院主办的一所以医学转化为主要特色的、研究型公立肿瘤专科医院。2016年2月26日，中国科学院正式批准医院更名为“中国科学院合肥肿瘤医院”，成为中科院序列唯一一所研究型肿瘤专科医院。
在中科院和安徽省暨合肥市的大力支持下，一所1500张床位的高水平、现代化三级甲等肿瘤专科医院正在合肥高新区紧锣密鼓的建设中，项目建成后将建成四个一流水平的中心，即“中科院合肥转化医学研究临床验证中心”、“中国科学院大学医学院附属教学中心”、“安徽省暨合肥市医疗产业驱动中心”和“区域性高水平肿瘤防治中心”，同时规划建设世界规模最大的肿瘤放射治疗中心。